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git clone すると

今時、gitは、github とか利用してるのでgit serverを運用してる人は稀だと思いますが、今回は自前で git server を運用している時です。

clone 時のログを確認して欲しのですが、確認方法はまず環境変数に

を追加。

それから、再度 git clone をすると、
/info/refs を参照してる部分があるので、該当箇所がサーバにあるのか確認すと、
/info のなかに、 refs が無い！

これを修復するためには、server のレポジトリがあるディレクトリに移動して

を実行してください。